Основная сложность настройки синхронизации состоит в создании связки между товарами в 1С и товарами в магазине.
При выгрузке товаров из 1С данные связки создаются автоматически, их хранит приложение и пользователь напрямую на них влиять не может.
Единственный способ связать уже существующие товары в 1С с товарами в магазине на InSales - это включить привязку по артикулам в настройках приложения:
Тогда при следующем полном обмене товарами привязки создадутся автоматически. Товары, ненайденные в магазине, создадутся в разделе Товары → Импорт/Экспорт в категории "1С Предприятие".
Синхронизация поддерживает артикулы вариантов товара.
О настройке взаимодействия 1С и магазина можно прочитать в статье Настройка взаимодействия с 1С нового магазина на примере Управление торговлей 10. В настройке режима обмена данными для первого обмена и создания привязок необходимо указать "Полная выгрузка данных"